数据集概述
本数据集提供核分割平台的标准化框架与量化基准测试数据,包含配对的核真实标注二值掩码和不同分割平台预测的分割二值掩码,分为内部开发数据与外部基准测试数据,用于转化研究中多重免疫荧光工作流程的核分割性能评估。
文件详解
- inhouse.zip
- 文件格式:ZIP
- 内容说明:包含用于核分割评估流水线开发的内部数据,其中Platforms目录下各ROI的分割二值掩码由internal.zip/DAPI_inhouse的原始DAPI核强度数据预测生成
- external.zip
- 文件格式:ZIP
- 内容说明:包含用于核分割性能基准测试的外部数据,含来自Synapse数据集(DOI:10.7303/SYN27624812)的真实标注二值掩码,ROIs_DAPI.csv记录ROI ID信息
- README_DAPI.md
- 文件格式:MD
- 内容说明:提供各分割平台预测核时所用原始DAPI核强度数据的位置信息
数据来源
Zenodo(DOI:10.5281/zenodo.12775616)、Synapse(DOI:10.7303/SYN27624812)
适用场景
- 核分割算法性能评估:用于基准测试不同平台在多重免疫荧光影像中的核分割准确性
- 医学影像分析流水线开发:支持转化研究中核分割评估流程的构建与优化
- 转化医学研究:为多重免疫荧光工作流程的标准化提供数据支撑
- 算法比较研究:对比不同核分割平台在真实临床数据中的表现差异