数据集概述
本数据集是硅藻属Nupela分子系统发育研究的补充材料,包含用于系统发育分析的分类单元、DNA序列数据、基因序列比对结果及最大似然树。数据支持对Nupela属新物种的描述,以及Nupela与Brachysira属亲缘关系的分析,为硅藻分类学研究提供分子数据支撑。
文件详解
- SUPPLEMENT S1.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:包含系统发育分析中使用的分类单元及对应的DNA序列数据来源信息
- SUPPLEMENT S2.fas
- 文件格式:FAS
- 字段映射介绍:采用FASTA格式存储的2基因DNA序列最终比对结果,用于系统发育分析
- SUPPLEMENT S3.tif
- 文件格式:TIF
- 字段映射介绍:基于163条rbcL和18S rDNA部分序列(共1806个字符)构建的Nupela物种最大似然树图像,标注有RAxML分析的 bootstrap支持值(<50未显示),以中心硅藻物种作为外类群
数据来源
论文“Preliminary molecular phylogeny of the diatom genus Nupela with the description of a new species and consideration of the interrelationships of taxa in the suborder Neidiineae D.G. Mann sensu E.J. Cox”
适用场景
- 硅藻分子系统发育研究:用于分析Nupela属及相关类群的亲缘关系和分类地位
- 硅藻新物种鉴定:支持Nupela indonesica sp. nov.等新物种的分子特征验证
- 硅藻分类学修订:为Nupela属与Brachysira属的分类界限划分提供分子证据
- 硅藻基因序列分析:用于rbcL和18S rDNA基因序列的比对和进化分析