数据集概述
本数据集为"桥梁样脂质转移蛋白对疟疾寄生虫侵袭阶段生成至关重要"预印本的辅助文件集，包含AlphaFold3预测的蛋白质结构、转染质粒序列及FFAT基序识别Python代码，支持相关研究的复现与扩展。
文件详解
- 结构文件（.zip格式）：
- Structure_PfVPS13L1.zip：含PfVPS13L1分段预测结构、PyMOL注释结构（.pse文件）
- Structure_PfVPS13L2.zip：含PfVPS13L2分段预测结构
- Structure_PfVPS13L5.zip：含PfVPS13L5分段预测结构
- Structure_PfVPS13L16.zip：含PfVPS13L16分段预测结构
- Structure_PfVPS13L1(1_2976) + PfVAP.zip：含PfVPS13L1 N端与PfVAP相互作用预测结构
- 质粒文件（.zip格式）：
- Plasmids_FFAT constructs.zip：FFAT构建体质粒序列
- Plasmids_Other constructs.zip：其他构建体质粒序列
- Plasmids_SLI.zip：SLI相关质粒序列
- Plasmids_Organelle markers for cKO or KS.zip：细胞器标记质粒序列
- 代码文件（.txt格式）：
- Code_BestFFAT_SleeMatrix.txt：基于Slee矩阵的FFAT基序识别Python代码
- Code_BestFFAT_PlasmoMatrix.txt：基于疟原虫矩阵的FFAT基序识别Python代码
适用场景
- 疟疾寄生虫分子机制研究：分析脂质转移蛋白结构与功能
- 蛋白质相互作用分析：验证PfVPS13L1与PfVAP的相互作用模式
- 基因工程应用：利用质粒序列进行疟原虫基因编辑实验
- 生物信息学分析：使用FFAT基序识别代码研究疟原虫蛋白质定位
