数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了RB1374品系(ocr-3(ok1559)X基因变异)成年雌雄同体线虫在NGM低蛋白胨培养基上的行为实验数据,包含视频追踪数据、特征提取结果及标准化格式文件,用于研究该基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 文件名称:ocr-3 (ok1557) on food R_2010_04_23__12_40_3789.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:线虫行为实验原始或基础数据存储文件,包含视频追踪的原始数据(如线虫位置、运动轨迹等)
- 文件名称:ocr-3 (ok1557) on food R_2010_04_23__12_40_3789.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(包含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:标准化线虫行为数据归档文件,wcon格式用于存储线虫运动轨迹、行为事件等结构化数据
- 文件名称:ocr-3 (ok1557) on food R_2010_04_23__12_40_3789_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:线虫行为特征提取结果文件,包含运动速度、弯曲度、摆动频率等行为特征参数
数据来源
C.elegans behavioural database(Schafer实验室,MRC Laboratory of Molecular Biology)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析ocr-3基因变异对秀丽隐杆线虫运动行为、觅食行为等表型的影响
- 线虫行为学实验方法验证: 基于标准化实验流程(E. Yemini等方法)验证行为学实验的可重复性
- 行为特征提取算法评估: 利用tierpsy软件提取的特征数据,评估线虫行为特征提取算法的准确性
- 基因-行为关联分析: 探索ocr-3基因与线虫特定行为表型之间的关联机制