数据集概述
本数据集为OctocoralTraits_v2_2压缩文件，包含支撑论文《The Octocoral Trait Database: a global database of trait information for octocoral species》的结构化数据、图表生成代码及数据验证代码，涵盖八放珊瑚物种性状数据、物种列表、系统发育树、海洋区域信息等内容，用于八放珊瑚性状研究相关分析与图表制作。
文件详解
- Code.R
- 文件格式：R脚本
- 字段映射介绍：用于在R环境（R studio 2023.06.0+421版本）中生成论文所有图表的带注释代码
- OctocoralTraits_v2_2.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：八放珊瑚性状数据库的首次数据发布版本，为论文图表制作的核心数据文件
- sp_id.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含数据库中所有已接受的八放珊瑚物种列表
- iqtree.tre
- 文件格式：树结构文件
- 字段映射介绍：用于构建八放珊瑚科级系统发育树的树对象，来源于McFadden et al. 2022的研究
- MEOW文件夹
- 包含内容：来源于Spalding et al. 2007《Marine Ecoregions of the World: A Bioregionalization of Coastal and Shelf Areas》的海洋区域信息
- Provinces_coord.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含海洋省份坐标信息，来源于Spalding et al. 2007的研究
- Table_ids文件夹
- 包含内容：存储数据库文件中对应ID信息的表格文件
- Validation文件夹
- 包含内容：Technical_validation.R文件，用于标记数据中的异常值、重复行及潜在结构错误（如一个observation_id关联多个资源、物种或位置）
数据来源
论文《The Octocoral Trait Database: a global database of trait information for octocoral species》
适用场景
- 八放珊瑚性状特征分析: 基于OctocoralTraits_v2_2.csv的性状数据，研究全球八放珊瑚物种的性状分布规律
- 珊瑚系统发育研究: 利用iqtree.tre的系统发育树数据，分析八放珊瑚科级分类单元的演化关系
- 海洋生物地理分析: 结合MEOW文件夹及Provinces_coord.csv的海洋区域数据，探究八放珊瑚性状与地理分布的关联
- 生物数据质量控制研究: 通过Validation文件夹的验证代码，参考八放珊瑚数据库的数据异常检测与处理方法
- 学术论文图表复现: 使用Code.R脚本，复现相关研究论文中的八放珊瑚性状分析图表
