数据集概述
本数据集包含从临床样本中分离的一株厌氧菌Odoribacter splanchnicus的鉴定验证数据。由于VITEK 2 ANC生化鉴定试剂盒无法识别该菌株,研究人员采用MALDI-TOF MS质谱技术进行初步鉴定(可信度评分为2.110),并通过16S rRNA基因测序进行进一步验证。BLAST同源性分析显示该分离株与Odoribacter splanchnicus(GenBank NR_074535.1)的16S rRNA序列完全匹配。数据集包含质谱图和系统发育树两个文档文件,为未来准确鉴定该细菌提供参考。
文件详解
- 质谱图文档
- 文件名称:
Odoribacter splanchnicus/the mass spectrometry figure of Odoribacter splanchnicus.docx
- 文件格式: DOCX
- 字段映射介绍: 包含通过MALDI-TOF MS Biotyper系统获得的Odoribacter splanchnicus的质谱图,用于细菌的蛋白质谱鉴定。
- 系统发育树文档
- 文件名称:
Odoribacter splanchnicus/Phylogenetic tree.docx
- 文件格式: DOCX
- 字段映射介绍: 包含基于16S rRNA基因序列构建的系统发育树,展示该临床分离株与Odoribacter splanchnicus标准菌株的进化关系。
适用场景
- 临床微生物鉴定: 为临床实验室鉴定罕见的或数据库未收录的厌氧菌(如Odoribacter splanchnicus)提供多方法验证参考。
- 细菌鉴定方法比较: 分析生化方法(VITEK 2)、质谱技术(MALDI-TOF MS)和基因测序(16S rRNA)在细菌鉴定中的一致性与局限性。
- 微生物分类学研究: 利用16S rRNA序列和系统发育树,研究Odoribacter splanchnicus及其近缘种的分类地位和进化关系。
- 医学实验室质量控制: 作为罕见菌株鉴定的质控案例,提升临床微生物鉴定的准确性和可靠性。