OGRDB_Based_NOD_ShiLtJ小鼠IGKV种系受体基因参考数据集

数据集概述

本数据集是发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB)的小鼠NOD/ShiLtJ品系IGKV基因座的种系参考集,包含4个相关文件,覆盖基因序列、元数据及许可说明三类文件类型,为免疫学研究提供标准化的基因参考数据。

文件详解

  • 许可文件
  • 文件名称:licence.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:包含数据集的许可声明,明确该材料采用Creative Commons CC0 1.0许可协议发布
  • 基因序列文件(无间隙)
  • 文件名称:ShiLtJ IGKV_rev_1_ungapped.fasta
  • 文件格式:FASTA
  • 字段映射介绍:存储NOD/ShiLtJ小鼠IGKV基因座的无间隙种系基因序列数据
  • 基因序列文件(带间隙)
  • 文件名称:ShiLtJ IGKV_rev_1_gapped.fasta
  • 文件格式:FASTA
  • 字段映射介绍:存储NOD/ShiLtJ小鼠IGKV基因座的带间隙种系基因序列数据
  • 元数据文件
  • 文件名称:ShiLtJ IGKV_rev_1.json
  • 文件格式:JSON
  • 字段映射介绍:包含该种系参考集的结构化元数据信息

数据来源

Open Germline Receptor Database(OGRDB)

适用场景

  • 免疫学研究:用于小鼠NOD/ShiLtJ品系B细胞受体基因多样性分析
  • 基因序列比对:作为IGKV基因座的参考序列,支持相关基因序列的比对与注释
  • 生物信息学工具开发:为免疫组库分析工具提供标准化的种系基因参考数据集
  • 遗传学研究:助力NOD/ShiLtJ品系特异性免疫相关基因的功能与进化研究
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.48 MiB
最后更新 2026年1月19日
创建于 2026年1月19日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。