数据集概述
本数据集是发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB)的小鼠NOD/ShiLtJ品系IGKV基因座的种系参考集,包含4个相关文件,覆盖基因序列、元数据及许可说明三类文件类型,为免疫学研究提供标准化的基因参考数据。
文件详解
- 许可文件
- 文件名称:licence.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含数据集的许可声明,明确该材料采用Creative Commons CC0 1.0许可协议发布
- 基因序列文件(无间隙)
- 文件名称:ShiLtJ IGKV_rev_1_ungapped.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:存储NOD/ShiLtJ小鼠IGKV基因座的无间隙种系基因序列数据
- 基因序列文件(带间隙)
- 文件名称:ShiLtJ IGKV_rev_1_gapped.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:存储NOD/ShiLtJ小鼠IGKV基因座的带间隙种系基因序列数据
- 元数据文件
- 文件名称:ShiLtJ IGKV_rev_1.json
- 文件格式:JSON
- 字段映射介绍:包含该种系参考集的结构化元数据信息
数据来源
Open Germline Receptor Database(OGRDB)
适用场景
- 免疫学研究:用于小鼠NOD/ShiLtJ品系B细胞受体基因多样性分析
- 基因序列比对:作为IGKV基因座的参考序列,支持相关基因序列的比对与注释
- 生物信息学工具开发:为免疫组库分析工具提供标准化的种系基因参考数据集
- 遗传学研究:助力NOD/ShiLtJ品系特异性免疫相关基因的功能与进化研究