数据集概述
本数据集为小鼠129S1/SvImJ品系的免疫球蛋白κ轻链可变区(IGKV)基因胚系参考集,发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB),包含4个相关文件,支持免疫球蛋白基因的序列分析与研究。
文件详解
- 非间隙序列文件
- 文件名称:SvImJ IGKV_rev_2_ungapped.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含小鼠129S1/SvImJ品系IGKV基因的非间隙胚系序列数据
- 间隙序列文件
- 文件名称:SvImJ IGKV_rev_2_gapped.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含小鼠129S1/SvImJ品系IGKV基因的带间隙胚系序列数据
- 元数据文件
- 文件名称:SvImJ IGKV_rev_2.json
- 文件格式:JSON
- 字段映射介绍:包含该IGKV基因胚系参考集的结构化元数据信息
- 许可文件
- 文件名称:licence.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含数据集的使用许可说明,标注采用Creative Commons CC0 1.0协议
数据来源
Open Germline Receptor Database (OGRDB)
适用场景
- 免疫球蛋白基因序列分析: 用于小鼠129S1/SvImJ品系IGKV基因胚系序列的比对与注释研究
- 抗体工程研究: 为基于小鼠129S1/SvImJ品系的抗体开发提供基因序列参考
- 免疫遗传学研究: 支持小鼠品系特异性免疫球蛋白基因多样性与进化分析
- 生物信息学工具验证: 可作为基准数据集测试免疫球蛋白基因相关分析工具的性能