数据集概述
本数据集是发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB)的小鼠LEWES/EiJ品系免疫球蛋白κ链可变区(IGKV)受体种系参考集,包含4个文件,涵盖序列数据、元信息及许可文件,为免疫遗传学研究提供标准化的种系受体序列资源。
文件详解
- EiJ IGKV_rev_1.json
- 文件格式:JSON
- 字段映射介绍:包含IGKV受体种系序列的元数据信息,可能涉及序列ID、注释、版本等结构化数据
- licence.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:记录数据集的许可声明,内容显示采用Creative Commons CC0 1.0协议发布
- EiJ IGKV_rev_1_ungapped.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:无间隙的IGKV受体种系核苷酸或氨基酸序列文件,包含序列标识符及对应序列信息
- EiJ IGKV_rev_1_gapped.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:带间隙的IGKV受体种系序列文件,用于序列比对或结构分析场景
数据来源
Open Germline Receptor Database (OGRDB)
适用场景
- 免疫遗传学研究:分析小鼠LEWES/EiJ品系IGKV受体种系序列的多样性与进化特征
- 抗体工程:为单克隆抗体开发提供种系受体序列参考模板
- 生物信息学工具验证:作为基准数据集测试免疫受体序列分析工具的准确性
- 比较免疫学研究:与其他小鼠品系或物种的IGKV种系序列进行比较分析