数据集概述
本数据集为小鼠LEWES/EiJ品系的IGL受体种系参考集,发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB)。包含带间隙、无间隙的基因序列文件、结构化数据文件及许可文件,共4个文件,支持生物信息学领域对该品系免疫球蛋白受体基因的研究。
文件详解
- 基因序列文件
- 文件名称:EiJ IGLV_rev_1_gapped.fasta、EiJ IGLV_rev_1_ungapped.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含小鼠LEWES/EiJ品系IGL受体种系基因的核苷酸序列,其中gapped版本含序列间隙,ungapped版本为连续序列
- 结构化数据文件
- 文件名称:EiJ IGLV_rev_1.json
- 文件格式:JSON
- 字段映射介绍:存储种系参考集的结构化元数据与序列注释信息
- 许可文件
- 文件名称:licence.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:声明数据集采用Creative Commons CC0 1.0许可协议,包含版权相关法律声明
数据来源
Open Germline Receptor Database (OGRDB)
适用场景
- 免疫遗传学研究:分析小鼠LEWES/EiJ品系IGL受体种系基因的序列特征与多样性
- 生物信息学工具开发:作为基准数据测试种系基因注释、序列比对等生物信息工具
- 比较基因组学分析:与其他小鼠品系或物种的IG受体种系数据进行跨物种/品系比较
- 基因数据库构建:补充生物数据库中特定小鼠品系的免疫球蛋白受体种系参考信息