数据集概述
本数据集是发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB)的小鼠MRL/MpJ品系IGKV基因种系参考集,包含该品系免疫球蛋白κ轻链可变区(IGKV)的基因种系序列数据及相关说明文件,支持免疫学领域对小鼠基因序列的研究与参考。
文件详解
- 基因序列文件
- 文件名称:MpJ IGKV_rev_1_gapped.fasta、MpJ IGKV_rev_1_ungapped.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:存储小鼠MRL/MpJ品系IGKV基因的种系序列数据,包含带间隙(gapped)和无间隙(ungapped)两种格式的序列
- 说明文件
- 文件名称:licence.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:记录数据集的版权信息,包含Creative Commons CC0 1.0许可声明及相关权利说明
- 元数据文件
- 文件名称:MpJ IGKV_rev_1.json
- 文件格式:JSON
- 字段映射介绍:存储数据集的元数据信息,可能包含基因集版本、物种信息、品系信息等结构化描述
数据来源
Open Germline Receptor Database(OGRDB)
适用场景
- 免疫学基因研究:用于分析小鼠MRL/MpJ品系IGKV基因的种系序列特征与结构
- 基因参考数据库构建:作为标准化基因序列参考,补充免疫学基因数据库资源
- 免疫球蛋白基因进化分析:对比不同品系小鼠IGKV基因的差异,研究基因进化规律
- 生物信息学工具验证:用于测试基因序列比对、注释等生物信息学工具的准确性