数据集概述
本数据集为小鼠NZB/BlNJ品系的IGKV免疫受体种系参考数据,发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB),包含未加 gap、加 gap 的序列文件、元数据文件及许可文件,共4个文件,用于免疫遗传学领域的受体序列分析。
文件详解
- 序列文件(.fasta格式)
- 文件名称:BlNJ IGKV_rev_1_ungapped.fasta、BlNJ IGKV_rev_1_gapped.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:存储小鼠NZB/BlNJ品系IGKV受体的种系核苷酸序列,其中ungapped版本为无间隔序列,gapped版本为带间隔序列
- 元数据文件(.json格式)
- 文件名称:BlNJ IGKV_rev_1.json
- 文件格式:JSON
- 字段映射介绍:包含数据集的元数据信息(如版本、物种、品系等)
- 许可文件(.txt格式)
- 文件名称:licence.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:记录数据集的许可协议(Creative Commons CC0 1.0)及版权声明
数据来源
Open Germline Receptor Database(OGRDB)
适用场景
- 免疫受体种系序列分析:用于研究小鼠NZB/BlNJ品系IGKV受体的种系序列特征与多样性
- 免疫遗传学研究:支撑B细胞受体(BCR)的基因重排、进化及功能机制分析
- 抗体工程应用:为抗体药物研发中IGKV受体的序列设计提供种系参考数据
- 免疫数据库构建:作为OGRDB的组成部分,补充小鼠品系特异性免疫受体数据资源