数据集概述
本数据集为小鼠PWD/PhJ品系的IGKV基因种系参考集,发布于开放种系受体数据库(OGRDB)。包含无间隙、有间隙的FASTA序列文件、JSON格式数据文件及许可证文件,共4个文件,用于提供该品系免疫球蛋白κ轻链可变区基因的标准化种系参考序列。
文件详解
- 许可证文件
- 文件名称:licence.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含数据集的版权声明,标注采用Creative Commons CC0 1.0许可协议
- 无间隙序列文件
- 文件名称:PhJ IGKV_rev_1_ungapped.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:存储小鼠PWD/PhJ品系IGKV基因的无间隙种系参考序列
- 有间隙序列文件
- 文件名称:PhJ IGKV_rev_1_gapped.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:存储小鼠PWD/PhJ品系IGKV基因的有间隙种系参考序列
- JSON数据文件
- 文件名称:PhJ IGKV_rev_1.json
- 文件格式:JSON
- 字段映射介绍:以结构化格式存储IGKV基因种系参考数据的元信息及序列相关属性
数据来源
Open Germline Receptor Database (OGRDB)
适用场景
- 免疫学研究: 用于分析小鼠PWD/PhJ品系免疫球蛋白κ轻链可变区基因的种系多样性及进化特征
- 生物信息学分析: 作为基因序列比对、注释的参考数据集,支持免疫组库测序数据的解读
- 基因工程应用: 为抗体工程、基因编辑等研究提供标准化的种系基因序列模板
- 数据库构建: 补充开放种系受体数据库(OGRDB)的小鼠品系基因参考资源,支持跨品系基因比较研究