数据集概述
本数据集为小鼠SJL/J品系的IGKV基因胚系参考序列集,由开放胚系受体数据库(OGRDB)发布,包含间隙型、无间隙型基因序列文件、许可证文件及元数据文件,支持免疫遗传学领域对小鼠免疫球蛋白受体基因的研究与分析。
文件详解
- 基因序列文件
- 文件名称:J IGKV_rev_1_gapped.fasta、J IGKV_rev_1_ungapped.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含小鼠SJL/J品系IGKV基因的胚系参考序列,其中gapped文件含基因序列间隙,ungapped文件为连续序列
- 元数据文件
- 文件名称:J IGKV_rev_1.json
- 文件格式:JSON
- 字段映射介绍:数据集相关元数据,可能包含基因注释、版本信息等结构化描述
- 许可证文件
- 文件名称:licence.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:记录数据集的使用许可声明,采用CC0 1.0协议
数据来源
Open Germline Receptor Database (OGRDB)
适用场景
- 免疫遗传学研究:分析小鼠SJL/J品系IGKV基因的胚系结构与多样性
- 抗体工程:为鼠源单克隆抗体的基因工程改造提供胚系序列参考
- 比较免疫学:对比不同小鼠品系IGKV基因的进化差异与功能特性
- 生物信息学工具开发:作为基准数据集验证免疫受体基因注释、比对工具的准确性