数据集概述
本数据集为小鼠DBA/2J品系的IGKV基因胚系参考集,发布于开放胚系受体数据库(OGRDB)。包含4个文件,涵盖带间隙、无间隙的基因序列文件、许可文件及JSON格式数据文件,是免疫遗传学领域研究小鼠DBA/2J品系IG受体基因的基础参考数据。
文件详解
- 文件名称:2J IGKV_rev_1_gapped.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:带间隙的小鼠DBA/2J品系IGKV基因胚系序列文件
- 文件名称:2J IGKV_rev_1_ungapped.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:无间隙的小鼠DBA/2J品系IGKV基因胚系序列文件
- 文件名称:licence.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含数据集许可信息,标注采用CC0 1.0协议发布
- 文件名称:2J IGKV_rev_1.json
- 文件格式:JSON
- 字段映射介绍:小鼠DBA/2J品系IGKV基因胚系参考集的结构化数据文件
数据来源
Open Germline Receptor Database (OGRDB)
适用场景
- 免疫遗传学研究: 用于分析小鼠DBA/2J品系IGKV基因胚系序列的结构与特征
- 抗体工程研究: 为小鼠单克隆抗体开发提供IGKV基因胚系序列参考
- 比较基因组学分析: 对比不同小鼠品系IG受体基因的胚系序列差异
- 生物信息学工具验证: 作为基准数据验证免疫受体基因序列分析工具的准确性