数据集概述
本数据集为小鼠A/J亚种的IGKV免疫球蛋白受体基因胚系参考集,发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB)。包含带间隙、无间隙的FASTA序列文件、JSON格式数据文件及许可证文件,共4个文件,用于免疫球蛋白受体基因的相关研究与分析。
文件详解
- 序列文件
- 文件名称:J IGKV_rev_2_gapped.fasta、J IGKV_rev_2_ungapped.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含小鼠A/J亚种IGKV基因胚系序列,其中带间隙文件含序列间隙信息,无间隙文件为连续序列。
- 数据文件
- 文件名称:J IGKV_rev_2.json
- 文件格式:JSON
- 字段映射介绍:存储IGKV基因胚系参考集的结构化数据信息。
- 许可证文件
- 文件名称:licence.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:记录数据集的使用许可,采用Creative Commons CC0 1.0协议。
数据来源
Open Germline Receptor Database(OGRDB)
适用场景
- 免疫球蛋白基因研究:分析小鼠A/J亚种IGKV基因的胚系序列特征与结构。
- 生物信息学序列比对:利用FASTA文件进行基因序列比对与同源性分析。
- 免疫遗传学数据库构建:为免疫受体基因数据库提供标准化参考数据。
- 基因进化分析:探究IGKV基因在小鼠亚种中的进化规律与变异特点。