OGRDB_Mouse_MSM_MsJ品系IGKV基因胚系参考数据集

数据集概述

本数据集是发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB)的小鼠MSM/MsJ品系IGKV基因胚系参考集,包含带间隙、无间隙的FASTA序列文件、JSON格式数据文件及许可说明文件,共4个文件,覆盖免疫遗传学研究所需的基因序列与元数据。

文件详解

  • 基因序列文件(FASTA格式)
  • 文件名称:MsJ IGKV_rev_1_gapped.fasta、MsJ IGKV_rev_1_ungapped.fasta
  • 文件格式:FASTA
  • 字段映射介绍:分别存储带间隙和无间隙的小鼠MSM/MsJ品系IGKV基因胚系序列数据,包含基因序列的标识符与碱基序列信息
  • 元数据文件(JSON格式)
  • 文件名称:MsJ IGKV_rev_1.json
  • 文件格式:JSON
  • 字段映射介绍:存储与IGKV基因胚系参考集相关的结构化元数据,可能包含基因注释、版本信息等内容
  • 许可文件(TXT格式)
  • 文件名称:licence.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:记录数据集的使用许可信息,明确采用Creative Commons CC0 1.0协议授权

数据来源

Open Germline Receptor Database(OGRDB)

适用场景

  • 免疫遗传学研究:分析小鼠MSM/MsJ品系IGKV基因的胚系序列特征与遗传多样性
  • 抗体工程:为单克隆抗体开发提供IGKV基因胚系序列参考
  • 比较基因组学:对比不同小鼠品系IGKV基因的序列差异与进化关系
  • 生物信息学工具验证:作为基准数据集测试免疫基因序列分析工具的准确性
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.64 MiB
最后更新 2026年1月23日
创建于 2026年1月23日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。