OGRDB_Source_小鼠CAST_EiJ品系IGH基因胚系参考数据集

数据集概述

本数据集为小鼠CAST/EiJ品系的IGH基因胚系参考序列,发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB)。包含无间隙、有间隙的FASTA序列文件、JSON格式数据文件及许可证文件,共4个文件,可用于免疫受体基因的序列分析与研究。

文件详解

  • EiJ IGH_rev_1_ungapped.fasta
  • 文件格式:FASTA
  • 字段映射介绍:小鼠CAST/EiJ品系IGH基因无间隙的胚系参考序列文件
  • EiJ IGH_rev_1_gapped.fasta
  • 文件格式:FASTA
  • 字段映射介绍:小鼠CAST/EiJ品系IGH基因带间隙的胚系参考序列文件
  • licence.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:包含数据使用许可声明,采用Creative Commons CC0 1.0协议
  • EiJ IGH_rev_1.json
  • 文件格式:JSON
  • 字段映射介绍:小鼠CAST/EiJ品系IGH基因胚系参考数据的结构化信息文件

数据来源

Open Germline Receptor Database (OGRDB)

适用场景

  • 免疫受体基因序列分析: 用于小鼠CAST/EiJ品系IGH基因胚系序列的比对、注释与变异分析
  • 免疫遗传学研究: 支持B细胞受体多样性、基因重组机制等免疫遗传学领域的基础研究
  • 生物信息学工具开发: 作为基准数据集,用于免疫受体序列分析工具的测试与优化
  • 比较基因组学研究: 与其他小鼠品系或物种的IGH基因胚系序列进行比较,探究进化关系
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.69 MiB
最后更新 2026年1月21日
创建于 2026年1月21日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。