数据集概述
本数据集为小鼠CAST/EiJ品系的IGH基因胚系参考序列,发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB)。包含无间隙、有间隙的FASTA序列文件、JSON格式数据文件及许可证文件,共4个文件,可用于免疫受体基因的序列分析与研究。
文件详解
- EiJ IGH_rev_1_ungapped.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:小鼠CAST/EiJ品系IGH基因无间隙的胚系参考序列文件
- EiJ IGH_rev_1_gapped.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:小鼠CAST/EiJ品系IGH基因带间隙的胚系参考序列文件
- licence.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含数据使用许可声明,采用Creative Commons CC0 1.0协议
- EiJ IGH_rev_1.json
- 文件格式:JSON
- 字段映射介绍:小鼠CAST/EiJ品系IGH基因胚系参考数据的结构化信息文件
数据来源
Open Germline Receptor Database (OGRDB)
适用场景
- 免疫受体基因序列分析: 用于小鼠CAST/EiJ品系IGH基因胚系序列的比对、注释与变异分析
- 免疫遗传学研究: 支持B细胞受体多样性、基因重组机制等免疫遗传学领域的基础研究
- 生物信息学工具开发: 作为基准数据集,用于免疫受体序列分析工具的测试与优化
- 比较基因组学研究: 与其他小鼠品系或物种的IGH基因胚系序列进行比较,探究进化关系