数据集概述
本数据集是发布于Open Germline Receptor Database（OGRDB）的小鼠CAST/EiJ品系IGKV基因种系参考集，包含基因序列文件、元数据文件及许可文件，共四个文件，覆盖基因序列的有间隙、无间隙版本及结构化信息，为免疫遗传学研究提供标准化基因参考数据。
文件详解
- 基因序列文件
- 文件名称：EiJ IGKV_rev_1_gapped.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：包含有间隙的IGKV基因种系序列数据
- 文件名称：EiJ IGKV_rev_1_ungapped.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：包含无间隙的IGKV基因种系序列数据
- 元数据文件
- 文件名称：EiJ IGKV_rev_1.json
- 文件格式：JSON
- 字段映射介绍：包含IGKV基因集的结构化元数据信息
- 许可文件
- 文件名称：licence.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：记录数据集的Creative Commons CC0 1.0许可声明及版权相关说明
数据来源
Open Germline Receptor Database（OGRDB）
适用场景
- 免疫遗传学研究：用于分析小鼠CAST/EiJ品系IGKV基因的种系结构与变异特征
- 抗体工程：为抗体分子设计提供种系基因序列参考数据
- 基因数据库构建：作为标准化基因参考集补充到免疫基因数据库中
- 比较基因组学：对比不同小鼠品系或物种间IGKV基因的进化差异
