数据集概述
本数据集是发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB)的小鼠NOD/ShiLtJ品系IGH基因受体种系参考集,包含4个文件,涵盖基因序列(含间隙和无间隙版本)、元数据及许可文件,为免疫基因组学研究提供标准化的基因参考数据。
文件详解
- 许可文件
- 文件名称:licence.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含Creative Commons CC0 1.0许可声明及版权相关说明,明确数据使用权限。
- 元数据文件
- 文件名称:ShiLtJ IGH_rev_1.json
- 文件格式:JSON
- 字段映射介绍:存储数据集的元数据信息,可能包含版本、物种、品系、基因类型等描述性内容。
- 基因序列文件(无间隙)
- 文件名称:ShiLtJ IGH_rev_1_ungapped.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含小鼠NOD/ShiLtJ品系IGH基因受体的无间隙种系基因序列。
- 基因序列文件(含间隙)
- 文件名称:ShiLtJ IGH_rev_1_gapped.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含小鼠NOD/ShiLtJ品系IGH基因受体的含间隙种系基因序列。
数据来源
Open Germline Receptor Database (OGRDB)
适用场景
- 免疫基因组学研究:分析小鼠NOD/ShiLtJ品系IGH基因受体的种系结构与变异特征。
- 抗体工程:为抗体分子设计与改造提供种系基因序列参考。
- 免疫疾病机制研究:探究该品系小鼠免疫相关疾病的基因受体分子基础。
- 生物信息学工具开发:作为标准化参考数据集,用于免疫组库分析工具的验证与优化。