数据集概述
本数据集是喙头蜥(Sphenodon punctatus)基因组项目的补充数据,包含从其基因组组装中识别出的嗅觉受体基因相关信息,涵盖完整嗅觉受体基因列表、系统发育关系推断所用的比对文件,以及从 scaffolds 中识别出的嗅觉受体基因(含假基因和部分基因)的Excel表格,共三个文件。
文件详解
- 完整嗅觉受体基因列表
- 文件名称:Intact SpORs_341 from geneious.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含喙头蜥基因组中识别出的完整嗅觉受体基因序列
- 系统发育关系比对文件
- 文件名称:Squamata_Tuatara_ORalignment.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:用于推断完整喙头蜥嗅觉受体与其他陆生有鳞目物种及两种鸟类嗅觉受体之间系统发育关系的序列比对文件
- 嗅觉受体基因识别表格
- 文件名称:Tuatara ORs_counts from geneious.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:从 scaffolds 中识别出的嗅觉受体基因列表,包含假基因和部分基因的相关数据
适用场景
- 生物基因研究:分析喙头蜥嗅觉受体基因的结构与功能特征
- 系统发育分析:基于比对文件研究喙头蜥与其他陆生有鳞目物种、鸟类嗅觉受体基因的进化关系
- 基因组注释验证:通过完整基因列表及假基因、部分基因数据,完善喙头蜥基因组的嗅觉受体基因注释
- 嗅觉受体基因多样性研究:统计分析喙头蜥嗅觉受体基因的数量、类型及分布情况