数据集概述
本数据集是经Fractal任务处理的3D类器官成像小测试数据集，基于原始tif文件（DOI：10.5281/zenodo.10683043）生成，采用ome-zarr格式。包含2022年6月4日由Nicole Repina在Friedrich Miescher Institute使用Yokogawa CV7000采集的单荧光通道（DAPI核染色）、两轮成像（R0、R1）的裁剪视场数据，共4个文件。
文件详解
- 文件名称：Readme.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含数据集采集信息（仪器、日期、采集者、机构）、成像参数（物镜、 binning、像素间距）、数据裁剪说明及通道信息
- 文件名称：workflow-export-zenodo_v2-1729687061441.json
- 文件格式：JSON
- 字段映射介绍：包含'type'（对象类型）、'keys'（含'name'任务名称、'task_list'任务列表两个键）
- 文件名称：220605_151046.zarr.zip
- 文件格式：ZIP（ome-zarr格式压缩包）
- 字段映射介绍：经处理的3D类器官成像核心数据，包含裁剪后的zyx维度（50,680,535像素）的成像数据
- 文件名称：220605_151046_mip.zarr.zip
- 文件格式：ZIP（ome-zarr格式压缩包）
- 字段映射介绍：可能为最大强度投影（MIP）处理后的3D类器官成像数据压缩包
数据来源
原始tif文件（DOI：10.5281/zenodo.10683043），由Friedrich Miescher Institute for Biomedical Research的Nicole Repina采集
适用场景
- 生物医学成像算法测试：用于验证3D类器官成像数据处理算法的兼容性与性能
- 荧光成像数据分析：研究DAPI核染色通道下3D类器官的结构特征
- 成像工作流复现：基于JSON文件中的Fractal任务信息复现数据处理流程
- ome-zarr格式应用测试：作为小数据集测试ome-zarr格式在3D生物成像数据存储与解析中的表现
