数据集概述
本数据集为类器官图像拼接处理后的Ome-zarr格式数据，由原始tifs文件经Fractal任务处理生成。包含3×4共12个带重叠的平铺视场，每个视场1000×1000像素，采用60倍水镜、2×2 binning采集，含5个z层切片，标记DAPI核染色和B-连环蛋白膜染色两个荧光通道。
文件详解
- 文件名称：README_fractal.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：记录实验细节，包括成像设备、物镜参数、像素尺寸、z步长、荧光通道信息及数据处理说明
- 文件名称：workflow-export-mip-1721654761504.json
- 文件格式：JSON
- 字段映射介绍：包含'name'（工作流名称）和'task_list'（任务列表）两个核心键，记录Fractal处理的工作流配置
- 文件名称：fractal_output.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包形式存储Ome-zarr格式的类器官拼接图像数据，包含平铺视场、z层切片及荧光通道信息
数据来源
弗里德里希·米歇尔生物医学研究所（Friedrich Miescher Institute for Biomedical Research）
适用场景
- 类器官图像拼接算法验证: 用于测试和优化医学成像中类器官图像的平铺拼接技术
- 生物医学成像数据处理流程研究: 分析Fractal任务处理原始tifs到生成Ome-zarr数据的工作流
- 类器官结构可视化分析: 基于Ome-zarr格式数据开展类器官三维结构、细胞分布的可视化研究
- 荧光标记图像分析: 利用DAPI和B-连环蛋白染色通道数据，研究类器官的核与膜结构特征
