数据集概述
本数据集包含OmniSegger对大肠杆菌图像分析的输出结果，涵盖增殖、形态学及三种模态（欠聚焦明场、过聚焦明场、细胞质荧光、膜荧光）共六个数据集。记录了不同培养条件、成像模式下大肠杆菌的生长图像数据，用于微生物生长分析。
文件详解
- 增殖数据集
- 文件名称：proliferation.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：OmniSegger处理的野生型MG1655大肠杆菌在4%琼脂糖垫上的相差图像输出，帧率3分钟/帧
- 形态学数据集
- 文件名称：morphology.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：OmniSegger处理的经10uM羟基脲处理的MG1655大肠杆菌在2%琼脂糖垫上的相差图像输出，帧率5分钟/帧
- 模态数据集-欠聚焦明场
- 文件名称：modality_BF_under.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：OmniSegger处理的TB28菌株在2%琼脂糖垫上的欠聚焦明场及荧光图像输出，图像取自焦平面下0.5um，帧率15分钟/帧
- 模态数据集-过聚焦明场
- 文件名称：modality_BF_over.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：OmniSegger处理的TB28菌株在2%琼脂糖垫上的过聚焦明场及荧光图像输出，图像取自焦平面上0.5um，帧率15分钟/帧
- 模态数据集-细胞质荧光
- 文件名称：modality_cyto_lysC.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：OmniSegger处理的ASKA collection来源lysC-GFP融合大肠杆菌菌株在2%琼脂糖垫上的相差及荧光图像输出，帧率7分钟/帧
- 模态数据集-膜荧光
- 文件名称：modality_mem_ygaW.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：OmniSegger处理的ASKA collection来源ygaW-GFP融合大肠杆菌菌株在2%琼脂糖垫上的相差及荧光图像输出，帧率7分钟/帧
数据来源
华盛顿大学Wiggins实验室
适用场景
- 微生物生长动力学研究：分析不同培养条件下大肠杆菌的增殖速率和生长周期
- 抗生素及化学试剂效果评估：研究羟基脲对大肠杆菌形态的影响
- 显微成像技术优化：比较不同聚焦状态（欠聚焦/过聚焦）对图像分析结果的影响
- 荧光标记蛋白定位研究：分析细胞质及膜蛋白荧光标记在大肠杆菌中的分布特征
- 微生物图像分割算法验证：使用OmniSegger输出数据验证图像分割算法的准确性
