数据集概述
本数据集为OMOP2OBO疾病事件映射数据V1.0，包含OMOP标准临床术语（SNOMED CT）与Human Phenotype Ontology（HPO）、Mondo本体的映射关系。映射通过OMOP2OBO算法自动生成或人工创建，经UMLS语义类型过滤后，采用TF-IDF词袋模型、余弦相似度计算等方法构建，支持医疗数据的语义与临床互操作。
文件详解
- 文件名称：
OMOP2OBO_V1.5_Condition_Occurrence_Mapping_Oct2020.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含OMOP疾病事件概念与HPO、Mondo本体的映射关系，涵盖映射类别（自动一对一/一对多概念/祖先、人工一对一/一对多、余弦相似度、未映射）、相似度得分等信息，记录不同映射方式下的术语关联。
数据来源
OMOP2OBO mapping algorithm及相关资源（GitHub: OMOP2OBO、Project Wiki: OMOP2OBO - wiki、Zenodo Community: OMOP2OBO、Preprint Manuscript: 10.5281/zenodo.5716421）
适用场景
- 医疗数据标准化：实现OMOP临床术语与生物医学本体的语义映射，提升跨系统数据互操作性。
- 生物医学研究：支持疾病表型、疾病分类的本体关联分析，助力精准医学研究。
- 医疗术语体系整合：为临床数据与生物医学本体的融合提供结构化映射参考。
- 医疗AI模型训练：作为术语映射基准数据，优化医疗自然语言处理或知识图谱构建模型。
