数据集概述
本数据集为Zenodo仓库中oncoEnrichR工具的两个使用案例分析结果,包含FGFR1网络(蛋白质邻近筛选)和EGFRi药物耐药驱动因素(CRISPR筛选)的预计算报告、输入数据及Docker复现代码,用于癌症基因集的生物信息学解释分析。
文件详解
- reports目录
- FGFR1 network(蛋白质邻近筛选)子目录
- 文件名称:fgfr1_network_oncoEnrichR.v1.4.1.html、fgfr1_network_oncoEnrichR.v1.4.1.xlsx
- 文件格式:HTML、XLSX
- 字段映射介绍:FGFR1网络使用案例的预计算分析报告及结果表格
- EGFRi drug resistance drivers(CRISPR筛选)子目录
- 文件名称:egfr_drug_resistance_oncoEnrichR.v1.4.1.html、egfr_drug_resistance_oncoEnrichR.v1.4.1.xlsx
- 文件格式:HTML、XLSX
- 字段映射介绍:EGFRi药物耐药驱动因素使用案例的预计算分析报告及结果表格
- input目录
- 文件名称:fgfr1_network_input.tsv、egfr_drug_resistance_input.tsv
- 文件格式:TSV
- 字段映射介绍:两个使用案例的原始输入数据文件
- docker目录
- 文件内容:包含Docker容器复现分析的输入数据、代码及操作说明,支持重新运行使用案例分析
数据来源
Zenodo仓库
适用场景
- 癌症基因集功能注释:利用预计算报告分析FGFR1网络及EGFRi耐药相关基因集的生物学意义
- 生物信息学工具验证:基于输入数据复现oncoEnrichR工具的分析流程,验证工具性能
- 癌症耐药机制研究:通过EGFRi药物耐药驱动因素分析结果,探索肿瘤耐药的分子机制
- 蛋白质网络分析:借助FGFR1网络的分析报告,研究癌症相关蛋白质的相互作用网络
- 生物信息学流程复现:使用Docker容器快速复现标准化的基因集解释分析流程