oncoEnrichR_Based_癌症基因集解释工具使用案例分析数据

数据集概述

本数据集为Zenodo仓库中oncoEnrichR工具的两个使用案例分析结果,包含FGFR1网络(蛋白质邻近筛选)和EGFRi药物耐药驱动因素(CRISPR筛选)的预计算报告、输入数据及Docker复现代码,用于癌症基因集的生物信息学解释分析。

文件详解

  • reports目录
  • FGFR1 network(蛋白质邻近筛选)子目录
  • 文件名称:fgfr1_network_oncoEnrichR.v1.4.1.html、fgfr1_network_oncoEnrichR.v1.4.1.xlsx
  • 文件格式:HTML、XLSX
  • 字段映射介绍:FGFR1网络使用案例的预计算分析报告及结果表格
  • EGFRi drug resistance drivers(CRISPR筛选)子目录
  • 文件名称:egfr_drug_resistance_oncoEnrichR.v1.4.1.html、egfr_drug_resistance_oncoEnrichR.v1.4.1.xlsx
  • 文件格式:HTML、XLSX
  • 字段映射介绍:EGFRi药物耐药驱动因素使用案例的预计算分析报告及结果表格
  • input目录
  • 文件名称:fgfr1_network_input.tsv、egfr_drug_resistance_input.tsv
  • 文件格式:TSV
  • 字段映射介绍:两个使用案例的原始输入数据文件
  • docker目录
  • 文件内容:包含Docker容器复现分析的输入数据、代码及操作说明,支持重新运行使用案例分析

数据来源

Zenodo仓库

适用场景

  • 癌症基因集功能注释:利用预计算报告分析FGFR1网络及EGFRi耐药相关基因集的生物学意义
  • 生物信息学工具验证:基于输入数据复现oncoEnrichR工具的分析流程,验证工具性能
  • 癌症耐药机制研究:通过EGFRi药物耐药驱动因素分析结果,探索肿瘤耐药的分子机制
  • 蛋白质网络分析:借助FGFR1网络的分析报告,研究癌症相关蛋白质的相互作用网络
  • 生物信息学流程复现:使用Docker容器快速复现标准化的基因集解释分析流程
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 24.74 MiB
最后更新 2026年1月26日
创建于 2026年1月26日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。