数据集概述
本数据集为卵菌进化多基因座时间尺度研究的分子钟模型数据,基于严格时钟、无相关松弛时钟和随机局部时钟三种模型估计卵菌分化时间,包含三种模型的XML格式结果文件,用于分析卵菌进化起源及主要类群分化时间。
文件详解
- 文件名称:StrictClockGamma_50mil.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:严格时钟模型下的卵菌进化时间尺度估计结果,包含多基因座序列进化参数、分化时间节点及置信区间等信息
- 文件名称:UCLDClockGamma_50mil.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:无相关松弛时钟模型下的卵菌进化时间尺度估计结果,包含基因进化速率变化参数、分化时间节点及置信区间等信息
- 文件名称:RandomClockGamma_50mil.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:随机局部时钟模型下的卵菌进化时间尺度估计结果,包含局部时钟速率变化参数、分化时间节点及置信区间等信息
数据来源
论文“A multilocus timescale for oomycete evolution estimated under three distinct molecular clock models”
适用场景
- 卵菌进化时间尺度研究:分析不同分子钟模型下卵菌起源及主要类群分化时间的差异
- 分子进化模型比较:对比严格时钟、松弛时钟及随机局部时钟模型在卵菌进化分析中的适用性
- 病原卵菌起源研究:结合分化时间数据探讨毁灭性病原卵菌的进化起源与宿主适应性
- 真核生物调控蛋白进化分析:基于卵菌祖先调控蛋白组成数据,研究真核生物基因表达调控系统的进化历程