数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)NL792品系gpc-1(pk298)X突变体的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的行为表现,包含实验条件、视频参数及分析文件,可用于研究gpc-1基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:gpc-1 (pk298)X on food R_2010_03_05__09_53_1412.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验原始数据及基础分析结果
- 特征数据文件
- 文件名称:gpc-1 (pk298)X on food R_2010_03_05__09_53_1412_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征提取数据,涉及19601个分割骨架信息
- 行为数据压缩包
- 文件名称:gpc-1 (pk298)X on food R_2010_03_05__09_53_1412.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储线虫行为数据,遵循wcon格式标准
数据来源
线虫行为数据库(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 基因功能研究: 分析gpc-1基因对秀丽隐杆线虫摄食行为的调控机制
- 线虫行为学分析: 基于视频参数和骨架数据研究线虫运动模式与环境的关系
- 神经生物学研究: 探索基因变异对线虫神经行为的影响路径
- 实验方法验证: 参考E. Yemini等的实验方法,优化线虫行为实验设计
- 生物信息学工具测试: 用于验证tierpsy等线虫行为分析软件的性能