数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了AQ1441品系(携带nca-2、unc-77基因突变及ljIs19转基因)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2011年10月13日开展,包含线虫在NGM低蛋白胨琼脂培养基上的行为记录,涉及基因、染色体、品系描述、实验条件及视频分析参数等信息。
文件详解
- 行为数据文件
- 文件名称:nca-1 (gk9) nca-2 (gk5) on food L_2011_10_13__13_01_4885.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始数据,包含视频帧、线虫骨架分割等基础信息
- 特征数据文件
- 文件名称:nca-1 (gk9) nca-2 (gk5) on food L_2011_10_13__13_01_4885_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含行为特征提取结果,对应线虫运动轨迹、姿态等分析指标
- 压缩行为数据文件
- 文件名称:nca-1 (gk9) nca-2 (gk5) on food L_2011_10_13__13_01_4885.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据文件,可能包含标准化格式的行为记录
数据来源
C. elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析nca-2、unc-77基因突变对秀丽隐杆线虫行为的影响
- 神经生物学实验验证: 验证基因变异与线虫运动行为的关联机制
- 行为学实验方法优化: 参考实验协议(如habituation时间、视频录制参数)改进线虫行为实验设计
- 行为数据分析工具测试: 基于HDF5格式的行为数据,测试或优化tierpsy等行为分析软件的性能
- 模式生物行为数据库补充: 为秀丽隐杆线虫行为数据库提供标准化的实验数据支撑