数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)VC731品系(携带unc-63(ok1075)I基因突变)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的行为特征,包含视频追踪数据、特征提取结果等,可用于研究unc-63基因对线虫行为的影响,共含3个文件。
文件详解
- 行为追踪数据文件
- 文件名称:
unc-63 (ok1075) on food L_2010_04_16__12_57_13___8___8.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为追踪的原始数据,对应实验过程中线虫的运动轨迹等基础记录
- 特征提取数据文件
- 文件名称:
unc-63 (ok1075) on food L_2010_04_16__12_57_13___8___8_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含经tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,对应19560个分段骨架等特征信息
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:
unc-63 (ok1075) on food L_2010_04_16__12_57_13___8___8.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩格式的线虫行为数据文件,包含实验相关的行为记录内容
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析unc-63(ok1075)I突变对线虫运动行为的影响,探究该基因在神经调控中的作用
- 模式生物行为学分析:基于视频追踪数据和特征提取结果,研究线虫在特定环境下的行为模式
- 行为实验方法验证:参考实验方案(如E. Yemini等人的方法),验证线虫行为实验的标准化流程
- 生物信息学工具应用:测试tierpsy软件在模式生物行为特征提取中的性能与准确性