数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了IK130品系pkc-1(nj3)V基因突变成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM低蛋白胨琼脂培养皿中进行,使用tierpsy软件追踪分析,包含视频转换数据、特征数据及骨架分割数据,可用于研究线虫行为模式与基因功能的关联。
文件详解
- 文件名称:pkc-1 (nj3) on food R_2010_07_22__12_46_5586.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为的wcon格式数据压缩包,记录实验过程中线虫的运动轨迹等基础行为数据
- 文件名称:pkc-1 (nj3) on food R_2010_07_22__12_46_5586_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,包含由tierpsy软件提取的运动特征指标
- 文件名称:pkc-1 (nj3) on food R_2010_07_22__12_46_5586.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫的骨架分割数据,共二万六千六百一十三条分割骨架,记录线虫身体形态的时序变化
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析pkc-1(nj3)V基因突变对秀丽隐杆线虫行为模式的影响
- 神经生物学实验: 探究线虫行为与神经调控通路的关联
- 生物信息学分析: 利用tierpsy提取的特征数据开展线虫行为特征的量化研究
- 实验方法验证: 参考E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为实验的标准化流程