数据集概述
本数据集围绕蛇类真菌病病原体Ophidiomyces ophidiicola的qPCR基因分型检测方法开发与应用展开，包含检测方法设计、验证数据及实际样本分型结果，用于研究该病原体的地理、分类学及时间分布偏好，助力蛇类真菌病流行病学分析。
文件详解
- README_Haynes_2023.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含数据集标题、作者信息（通讯作者Ellen Haynes及所属机构）、文件生成与更新时间（2023-04-17生成，2023-08-16更新）等数据集基本信息。
- Haynes_2023_ophidiomyces_genotyping_data.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含qPCR基因分型检测的验证数据（如与全基因组测序结果的一致性、灵敏度、特异性）、实际样本分型结果（样本所属蛇类物种、来源州、采集年份对应的克隆谱系）、多分类逻辑回归模型预测结果等数据。
数据来源
野生动物流行病学实验室（University of Illinois College of Veterinary Medicine）
适用场景
- 蛇类真菌病流行病学研究: 分析Ophidiomyces ophidiicola克隆谱系的地理分布、宿主偏好及时空变化趋势。
- 分子检测方法验证: 评估qPCR基因分型检测方法的准确性、灵敏度与特异性，为临床检测提供参考。
- 病原体进化分析: 基于克隆谱系数据研究Ophidiomyces ophidiicola的遗传多样性、重组情况及进化关系。
- 疾病防控策略制定: 根据克隆谱系的地理分布特征，制定针对性的蛇类真菌病监测与防控措施。
