数据集概述
本数据集为蛇尾科（Ophiocomidae）蛇尾星的系统发育基因组学研究数据，涵盖39个物种的靶向捕获与测序数据，用于验证现有属的单系性并修订分类系统，识别出4个有效属，同时分析形态差异、线粒体基因组特征及繁殖发育模式等内容。
文件详解
- Ophiocomid_Dryad_ReadMe_v2.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：数据集说明文档，包含数据采集、处理方法及文件内容概述
- StarBEAST_exons.zip
- 文件格式：ZIP（压缩包）
- 字段映射介绍：StarBEAST分析用外显子序列数据压缩包，包含系统发育树构建相关的基因序列文件
- EC_pipeline-2.zip
- 文件格式：ZIP（压缩包）
- 字段映射介绍：EC分析流程压缩包，包含系统发育基因组学分析的流程脚本与中间数据
- Gene_Table_v3.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：基因信息表格，包含物种基因序列的样本信息、基因名称及注释等字段
- phylogenetic_data.zip
- 文件格式：ZIP（压缩包）
- 字段映射介绍：系统发育分析数据压缩包，包含多物种 coalescent 分析及化石校准相关的原始序列与结果文件
数据来源
Dryad（关联论文：Phylogenomics, life history and morphological evolution of ophiocomid brittlestars）
适用场景
- 蛇尾科分类系统修订研究：基于系统发育树验证属级分类单元的单系性，支持分类学修订
- 形态演化分析：利用形态差异数据研究蛇尾科不同类群的形态分化速率与模式
- 线粒体基因组特征研究：分析蛇尾科物种线粒体基因组的基因重排、碱基组成及核线粒体基因 divergence
- 繁殖发育模式探究：结合幼虫培养数据研究蛇尾科物种的繁殖策略（如裂殖无性繁殖）与分布扩散机制
- 生物地理演化分析：通过化石校准节点年龄研究蛇尾科物种跨大洋分布与地质事件（如巴拿马地峡闭合）的关联
