数据集概述
本数据集包含马来西亚眼镜王蛇(Ophiophagus hannah)的毒腺转录组与毒液蛋白质组研究数据,通过Illumina HiSeq™平台和1D-SDS-PAGE-nano-ESI-LCMS/MS技术分析,揭示了毒素基因的冗余性、家族多样性及表达丰度,涉及23个毒素家族,为理解蛇毒变异及中毒病理生理提供基础。
文件详解
- 多序列比对文件(.mfa)
- 文件名称:Fig.7_SVMP_Jalview.mfa、Fig.10_Vespryn_Jalview.mfa、Fig.5c_3FTx_SNTX_Jalview.mfa、Fig.12_CVF_Jalview.mfa、Fig.9_LAAO_Jalview.mfa、Fig.8_CRISP_Jalview.mfa、Fig.5b_3FTx_LNTX_Jalview.mfa、Fig.6_3FTxs_phylo_alignment_Mega6.mas(注:.mas为序列比对文件)
- 文件格式:MFA、MAS
- 字段映射介绍:包含不同毒素家族(如3FTxs、SVMPs、LAAOs等)的氨基酸序列比对信息,用于基因进化与序列多样性分析。
- 表格数据文件(.xlsx)
- 文件名称:Additional File 3_MOh_Proteome.xlsx、Additional File 4_MOh_BOh_sequence comparison.xlsx、Additional File 2_MOh_Transcriptome.xlsx、Additional File 1_MOh_annotations.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:涵盖转录组FPKM值、蛋白质组丰度、毒素家族注释、马来西亚与巴厘岛眼镜王蛇序列对比等结构化数据。
- 系统发育树文件(.nwk)
- 文件名称:Fig.6_3FTxs_phylo_FigTree.nwk
- 文件格式:NWK
- 字段映射介绍:3FTxs家族的系统发育树结构数据,用于毒素进化关系分析。
适用场景
- 蛇毒毒素组学研究: 分析毒素家族的多样性、表达丰度及基因复制机制。
- 中毒病理生理机制探讨: 关联毒素组成与神经麻痹、组织坏死等中毒症状的关系。
- 抗蛇毒血清研发: 基于毒素序列差异评估现有抗血清的中和效果,指导新型抗血清开发。
- 生物进化分析: 通过毒素序列比对与系统发育树研究眼镜王蛇的地理种群变异。
- 生物医学应用: 挖掘蛇毒成分在药物开发中的潜在价值,如酶抑制剂、神经调节剂等。