数据集概述
本数据集为马达加斯加鬣蜥亚科(Oplurinae)物种的系统地理结构研究数据,包含多基因座DNA序列数据及相关分析文件。通过放松时钟模型估算物种树和分化时间,分析Oplurus属两个姐妹种(O. cuvieri和O. cyclurus)的种群遗传结构与分化时间,探究物种多样性形成机制,共包含13个文件。
文件详解
- XML文件(共10个)
- 文件名称:如ocuvND1con02b.xml、ocycND1exp_ucld02b.xml、subA01.xml等
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:包含系统地理分析相关的元数据,如物种分化时间估算、种群遗传结构分析的参数设置与结果数据,具体字段需结合研究内容解析
- NEX文件(共3个)
- 文件名称:oplurineUBN1.nex、oplurineND1.nex、oplurinePRLR.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:多基因座DNA序列数据文件,包含Oplurinae属物种的UBN1、ND1、PRLR等基因的序列信息,用于构建物种树与系统发育分析
数据来源
论文“Defining spatial and temporal patterns of phylogeographic structure in Madagascar's iguanid lizards (Genus Oplurus)”
适用场景
- 鬣蜥属系统发育研究: 利用多基因座序列数据构建物种树,分析马达加斯加鬣蜥属的系统发育关系
- 物种分化时间估算: 通过放松时钟模型,探究Oplurinae亚科物种的分化时间与演化历史
- 种群遗传结构分析: 解析O. cuvieri和O. cyclurus的种群地理分布模式与遗传分化机制
- 生物多样性形成机制研究: 结合时空尺度数据,验证更新世气候波动对物种多样性的影响
- 保护生物学应用: 基于系统地理结构,为马达加斯加特有鬣蜥物种的保护策略制定提供科学依据