数据集概述
本数据集为虎鲸全球辐射与多样化地理时间动态研究的相关数据,包含7个文件,覆盖基因分型、系统发育分析输入输出、物种分类等数据,用于探究晚更新世气候变化对虎鲸种群演化、扩散及生态多样化的影响,支持全球分布海洋哺乳动物的辐射与分化机制研究。
文件详解
- Dataset_S1_AS7genotypes.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:虎鲸AS7基因型数据文件,包含研究中样本的基因型信息,为种群遗传分析提供基础数据
- Dataset_S2_Beast_in_158mtGen_partitioned.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:158个线粒体基因组分区的Beast分析输入文件,用于系统发育分析的参数设置与数据配置
- Dataset_S3_Beast_out_158mtGen_partitioned_consant.tre
- 文件格式:TRE
- 字段映射介绍:158个线粒体基因组分区Beast分析输出的系统发育树文件,记录种群演化关系结果
- Dataset_S4_SNAPPinput_AS7_42SNP_113indiv.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:42个SNP位点、113个个体的SNAPP分析输入文件,用于种群分化时间估算的参数配置
- Dataset_S5_SNAPPoutput_AS7_42SNP_113indiv.trees
- 文件格式:TREES
- 字段映射介绍:42个SNP位点、113个个体的SNAPP分析输出树文件,包含种群分化时间估算结果
- Dataset_S6_Delphinidae.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:海豚科相关的XML元数据文件,提供物种分类背景信息
- Dataset_S7_Delphinidae.tree
- 文件格式:TREE
- 字段映射介绍:海豚科系统发育树文件,记录海豚科物种的演化关系
数据来源
论文“Geographic and temporal dynamics of a global radiation and diversification in the killer whale”
适用场景
- 虎鲸种群遗传结构分析: 利用基因型数据探究全球虎鲸种群的遗传多样性与分化模式
- 海洋哺乳动物演化时间估算: 通过系统发育分析输出文件,研究虎鲸辐射与多样化的时间动态
- 气候变化对物种分布影响研究: 结合种群扩散数据,分析晚更新世冰期循环对虎鲸栖息地变化及种群动态的作用
- 生态多样化机制研究: 基于基因流与系统发育结果,探讨虎鲸生态型形成的潜在驱动机制
- 物种系统发育关系构建: 利用海豚科系统发育树文件,辅助海洋哺乳动物分类与演化关系研究