数据集概述
本数据集围绕水稻亚种(籼稻、粳稻)的同源二倍体F1杂交种(9N、N9)及节段异源四倍体(99NN、NN99)展开,对比其在正常与低氮条件下的表型表现,同时包含18个生长相关通路基因的表达数据及基因分型数据,揭示其耐氮缺乏的分子机制。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称:Readme.txt、Sun_2021__DATA_README_updated_23Mar2022.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:提供研究背景、植物材料说明(亲本、杂交种、多倍体类型)及数据文件的基本说明
- 表型数据文件
- 文件名称:1.Phenotypic_data.xlsx、1.Sun_2021_Phenotypic_data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含不同处理条件(CK正常氮、LN低氮)下水稻地上/地下部形态与生理参数,工作表名称对应具体测定指标
- 基因表达数据文件
- 文件名称:2.Realtime_PCR_Total_gene_expression.xlsx、2.Sun_2021_qPCR_total_gene_expression-updated.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:通过qRT-PCR的ΔΔCT法量化18个生长相关通路基因的总表达量
- 基因分型与同源表达数据文件
- 文件名称:3.MassARRAY_Homoeologous_expression_data.xlsx、3.Sun_MassARRAY_genotyping.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:基于Sequenom MassARRAY平台的基因分型数据及同源基因表达数据
适用场景
- 水稻耐氮胁迫机制研究: 分析杂交种与多倍体水稻在低氮条件下的表型优势及分子调控机制
- 植物多倍体与杂交优势研究: 对比二倍体杂交种与四倍体的耐氮特性差异,探究多倍体化对胁迫耐受性的影响
- 农业氮高效利用研究: 为水稻氮高效品种选育提供表型与分子数据支撑
- 基因表达调控分析: 结合18个生长相关基因的表达数据,解析氮缺乏响应的关键通路