数据集概述
本数据集为水稻幼苗耐寒性相关转录组分析结果,包含野生型ZH11与OsMST6突变体mst6-1在0小时、4小时低温处理后的转录组数据。数据支撑论文中抗寒调控通路(OsERF120激活OsMST6增强耐寒性)的分析,可用于研究水稻低温响应的分子机制。
文件详解
- 文件名称:README.md
- 文件格式:MD
- 字段映射介绍:包含数据集背景说明、数据来源(DOI链接)、样本处理信息(14天幼苗4℃低温处理0h/4h)
- 文件名称:Dataset_1_DEGs_in_ZH11_and_mst6-1.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:ZH11与mst6-1在不同低温处理时间的差异表达基因(DEGs)数据
- 文件名称:Dataset_2_KEGG_and_GO_terms.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:差异表达基因的KEGG通路注释和GO功能注释数据
- 文件名称:Dataset_3_Gene_information_of_ABA-activated_signaling_and_PP2Cs.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:ABA激活信号通路相关基因及PP2Cs基因的信息数据
数据来源
Dryad数据库(DOI: 10.5061/dryad.280gb5mw1)
适用场景
- 水稻抗寒分子机制研究:分析OsMST6、OsERF120在低温响应中的调控作用
- 转录组差异表达分析:对比野生型与突变体在低温处理后的基因表达变化
- 信号通路注释:通过KEGG和GO注释数据解析水稻低温响应的关键通路
- 分子育种应用:为水稻耐寒性分子标记开发提供基因靶点数据
- ABA信号通路研究:探究ABA通路基因在水稻抗寒中的功能