数据集概述
本数据集围绕欧洲海带物种隐存种快速识别与遗传多样性特征分析工具开发展开,包含新开发的微卫星位点序列、基因型数据表及COI序列等,为海带物种遗传多样性研究及保护提供工具与数据支持。
文件详解
- 文档文件:
- README_for_DataS1.pdf:PDF格式,提供数据集的说明文档,包含数据背景、文件结构及使用方法等信息。
- 序列文件(FASTA格式):
- mauger_et_al_2021_contigs_of_new_monomorphic_loci.fasta:新开发的单态性位点序列文件
- mauger_et_al_2021_COI_sequences_for_all_samples.fasta:所有样本的COI序列文件
- mauger_et_al_2021_COI_concensus_sequences_for_four_species.fasta:四个物种的COI共识序列文件
- mauger_et_al_2021_contigs_of_new_polymorphic_loci.fasta:新开发的多态性位点序列文件
- mauger_et_al_2021_contigs_of_published_loci.fasta:已发表位点的序列文件
- 基因型数据文件(CSV格式):
- mauger_et_al_2021_genotype_tables_for_single_population_sampling.csv:单种群采样的基因型数据表
- mauger_et_al_2021_genotype_tables_for_wide_scale_sampling.csv:大范围采样的基因型数据表
适用场景
- 海带物种隐存种快速识别研究
- 欧洲海带物种遗传多样性特征分析
- 海洋生态系统保护与恢复策略制定
- 微卫星标记跨物种扩增有效性验证
- 物种特异性PCR鉴定方法开发