数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了OW940菌株(携带alpha-Synuclein::YFP标记)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2014年4月1日在荷兰欧洲衰老生物学研究所开展,包含线虫在NGM低蛋白胨琼脂培养基中的运动行为记录及分析结果,共3个文件。
文件详解
- 行为特征文件:22_R_3_OW940_4_day1_CCW_2014_04_01__10_41_3666_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含运动轨迹、速度、弯曲度等行为学指标
- 原始分析文件:22_R_3_OW940_4_day1_CCW_2014_04_01__10_41_3666.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验原始数据及基础处理结果,可能涵盖视频帧解析、线虫骨架 segmentation 数据等
- 行为数据压缩包:22_R_3_OW940_4_day1_CCW_2014_04_01__10_41_3666.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据,可能包含符合WCON(Worm Behavior Data Format)标准的运动轨迹数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫神经生物学研究:分析alpha-Synuclein标记线虫的运动行为特征,探究神经退行性疾病相关机制
- 行为学实验方法验证:基于标准化实验流程(参考E.Yemini等的方法),验证线虫行为分析的重复性与可靠性
- 衰老生物学研究:对比不同日龄线虫的行为差异,研究衰老对秀丽隐杆线虫运动能力的影响
- 模式生物行为数据库构建:补充线虫行为数据库的菌株特异性数据,支持大规模行为学数据整合分析