数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了OW940菌株(表达α-突触核蛋白YFP融合蛋白)成年线虫的行为观测实验数据,包含实验环境参数、视频采集信息及生成的行为分析文件,用于衰老生物学相关的线虫行为研究。
文件详解
- 54_R_3_OW940_2_day3_CW_2014_03_19__15_00_04614.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩归档文件,可能包含实验相关的元数据或配置文件
- 54_R_3_OW940_2_day3_CW_2014_03_19__15_00_04614_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:行为特征数据文件,存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征参数
- 54_R_3_OW940_2_day3_CW_2014_03_19__15_00_04614.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:核心实验数据文件,包含20379个分割骨架数据,记录线虫运动的时空特征
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 衰老相关行为研究:分析成年3天线虫的运动行为特征,探究衰老对秀丽隐杆线虫行为的影响
- 神经退行性疾病模型研究:基于α-突触核蛋白表达线虫,研究相关蛋白对行为的调控机制
- 线虫行为分析算法验证:用于测试和优化tierpsy等线虫行为追踪软件的算法性能
- 实验环境对行为影响研究:结合NGM培养基、OP50食物等参数,分析环境因素对线虫行为的作用
- 行为特征量化分析:利用骨架数据和特征文件,量化线虫的运动轨迹、速度等行为指标