数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了OW949菌株(携带zgIs125[P(dat-1)::alpha-Synuclein::YFP]转基因)成年线虫的行为实验数据。实验于2014年4月3日开展,使用tierpsy软件采集并分析线虫在NGM培养基上的运动特征,包含原始数据、特征数据及标准化格式数据,共计3个文件。
文件详解
- 行为数据文件组
- 文件名称:50_R_3_OW949_5_day7_CCW_2014_04_03__14_53_17613.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:推测包含线虫行为观测的原始数据,如视频帧对应的线虫骨架、坐标等基础运动信息
- 文件名称:50_R_3_OW949_5_day7_CCW_2014_04_03__14_53_17613_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:推测包含提取的线虫行为特征数据,如运动速度、弯曲频率、身体姿态参数等
- 文件名称:50_R_3_OW949_5_day7_CCW_2014_04_03__14_53_17613.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(内含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:推测为线虫行为数据的标准化交换格式文件,包含结构化的运动行为记录
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 模式生物行为学研究:分析转基因线虫的运动模式、行为特征及表型差异
- 神经退行性疾病模型研究:以表达alpha-Synuclein的线虫为模型,探究相关蛋白对运动功能的影响
- 行为分析软件验证:用于测试或优化tierpsy等线虫行为分析工具的算法性能
- 衰老相关行为变化研究:对比不同成年天数线虫的行为差异,探索衰老对运动能力的影响