数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫OW949菌株(表达alpha-Synuclein::YFP)的行为实验数据,记录了成年9天雌雄同体线虫在NGM低蛋白胨琼脂培养基中的运动行为。实验由欧洲衰老生物学研究所完成,使用tierpsy软件追踪分析,包含视频及特征数据文件。
文件详解
- 行为特征文件:
33_R_2_OW949_6_day9_CW_2014_03_16__15_46_18___1___9_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫运动行为特征数据,基于tierpsy软件提取的运动参数
- 实验数据文件:
33_R_2_OW949_6_day9_CW_2014_03_16__15_46_18___1___9.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验原始追踪数据,包含20880个分段骨架信息、帧率(26.2467帧/秒)、视频像素分辨率(4.48528微米/像素)等参数
- 行为数据压缩文件:
33_R_2_OW949_6_day9_CW_2014_03_16__15_46_18___1___9.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据,采用wcon格式(线虫行为数据标准格式)
数据来源
C.elegans behavioural database
适用场景
- 神经退行性疾病模型研究:分析alpha-Synuclein表达对秀丽隐杆线虫运动行为的影响,模拟帕金森病相关病理
- 模式生物行为学分析:研究成年线虫运动行为特征与衰老的关联
- 生物图像追踪技术验证:评估tierpsy软件在模式生物行为追踪中的应用效果
- 药物筛选模型构建:基于线虫运动行为数据建立神经疾病药物筛选的表型模型