数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了OW956菌株(携带zgIs144[P(dat-1)::YFP]转基因)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2014年3月20日开展,包含线虫在NGM低蛋白胨琼脂培养基中的运动行为追踪记录,以及对应的特征数据和标准化格式文件。
文件详解
- 行为数据压缩包
- 文件名称:15_R_3_OW956_6_Day2_CCW_2014_03_20__08_54_4674.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为的标准化WCON格式数据,记录运动轨迹等核心行为信息
- 特征数据文件
- 文件名称:15_R_3_OW956_6_Day2_CCW_2014_03_20__08_54_4674_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含运动参数、形态特征等分析指标
- 原始追踪数据文件
- 文件名称:15_R_3_OW956_6_Day2_CCW_2014_03_20__08_54_4674.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验的原始追踪数据,涉及21044个分割骨架数据,以及帧率、像素分辨率等实验参数
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫神经行为学研究:分析转基因菌株(P(dat-1)::YFP)的运动模式与神经基因表达的关联
- 衰老相关行为变化研究:对比成年第2天线虫与其他日龄个体的行为差异,探究衰老对行为的影响
- 模式生物行为特征提取:验证tierpsy软件在秀丽隐杆线虫行为特征量化中的应用效果
- 转基因线虫表型分析:评估zgIs144转基因元件对秀丽隐杆线虫运动行为的调控作用
- 微生物-宿主相互作用研究:分析OP50大肠杆菌食物源对线虫行为的影响机制