数据集概述
本数据集记录棕硬尾鸭(Oxyura jamaicensis)逐步定殖安第斯山脉的过程及β珠蛋白变异进化情况,包含线粒体DNA、常染色体内含子及血红蛋白基因测序数据,揭示其从北美到热带安第斯再到南美南部的定殖路径与基因适应机制,共含2个文件。
文件详解
- 文件名称:oxyura_jamaicensis_files.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包文件,推测包含棕硬尾鸭的线粒体DNA、4个常染色体内含子、3个血红蛋白基因(αA、αD、βA)的测序数据及相关分析文件
- 文件名称:genbank_accessions_seqids.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含测序文件与GenBank登录号的映射关系,示例内容为测序文件ID(如1-oxja-mtDNA.sqn)、样本标识(如329BB)与GenBank登录号(如AM084943)的对应记录
数据来源
论文“Stepwise colonization of the Andes by Ruddy Ducks and the evolution of novel β-globin variants”
适用场景
- 鸟类进化研究:分析棕硬尾鸭定殖安第斯山脉的路径与基因适应机制
- 血红蛋白基因变异分析:研究β珠蛋白氨基酸替换与高海拔/低海拔环境适应的关联
- 生物地理分布研究:对比棕硬尾鸭与其他水鸟定殖安第斯山脉的不同路线
- 种群遗传学分析:利用线粒体DNA及常染色体内含子数据研究种群历史与基因流模式