数据集概述
本数据集围绕迁徙鸟类彩鹀（Painted Bunting）换羽表型的遗传与生态驱动因素展开，包含全基因组测序、稳定同位素分析及基因-环境关联分析相关数据，覆盖13个繁殖地的种群遗传结构与换羽表型信息，共9个文件，用于探究换羽性状的遗传基础及环境选择压力。
文件详解
- 说明文档
- 文件名称：README.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：数据集说明文档，包含研究背景、数据采集与分析方法等信息
- 基因型数据文件
- 文件名称：PABU_clean.SNP.rm_hets.RegionFID.map、PABU_clean.SNP.rm_hets.RegionFID.ped、PABU_clean.SNP.rm_hets.RegionFID.imputed_gt.fix_name.chr1.new_pheno_inclLA.noNA.fam、PABU_clean.SNP.rm_hets.RegionFID.imputed_gt.fix_name.chr1.new_pheno_inclLA.noNA.bim、PABU_clean.SNP.rm_hets.RegionFID.imputed_gt.fix_name.chr1.new_pheno_inclLA.noNA.bed
- 文件格式：MAP、PED、FAM、BIM、BED
- 字段映射介绍：包含彩鹀种群的SNP基因型数据，记录个体遗传标记、种群结构及表型信息
- 分析结果文件
- 文件名称：PABU_clean.SNP.rm_hets.RegionFID.bslmm1.frq.strat.4gradientforest.wide2.csv、PABU.cand_genes.RegionFID.frq.strat
- 文件格式：CSV、STRAT
- 字段映射介绍：基因频率分层分析结果、梯度森林分析数据及候选基因频率统计
- 环境数据文件
- 文件名称：pabuwenv.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含繁殖地的地理坐标（Lat、Long）及环境变量（降水、干旱等气候因子）
数据来源
论文“Genetic and ecological drivers of molt in a migratory bird”
适用场景
- 迁徙鸟类换羽表型遗传基础研究: 利用GWAS数据识别与换羽相关的候选基因（如GLI2、CSPG4）
- 基因-环境关联分析: 探究换羽基因变异与降水、干旱等环境因子的关联
- 种群遗传结构分析: 基于SNP数据解析彩鹀不同繁殖地的种群遗传分化
- 进化生态学研究: 分析换羽性状的自然选择压力及适应性进化机制
- 迁徙鸟类保护策略制定: 为彩鹀等迁徙鸟类的栖息地保护提供遗传与生态依据
