数据集概述
本数据集通过PacBio全长16S rRNA基因测序,比较两种初始社会性木蜂(Xylocopa sonorina和Xylocopa tabaniformis)不同地理种群的嗉囊与肠道微生物组结构,包括核心分类群、物种特异性变异及种群水平分化特征,揭示微生物组与宿主的关联机制。
文件详解
- README_Xylocopa.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:数据集说明文档,包含研究背景、实验设计、数据处理流程及文件说明等内容
- feat_final.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含ASV序列、分类学信息(界、门、纲、目、科、属、种)、ASV编号及多个样本(如183C、183G等)的微生物丰度数据
- tree_others_new.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含细菌分类学信息(界、门、纲、目、科、属、种)、模式菌株及RefSeq项目编号等系统发育相关数据
- Xylocopa_Meta.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:木蜂样本元数据文件,推测包含样本编号、地理种群、宿主物种等实验相关信息(具体字段以实际文件为准)
数据来源
标题为“Comparing bacterial microbiome composition of Xylocopa species across populations using PacBio 16S rRNA gene sequencing”的研究
适用场景
- 蜜蜂微生物组结构研究: 分析木蜂嗉囊与肠道核心微生物分类群组成及物种特异性差异
- 微生物种群分化分析: 探究核心微生物分类群的种群水平变异及分化机制
- 测序技术对比研究: 评估长读长16S rRNA测序在微生物变异检测中的优势
- 宿主-微生物互作机制分析: 揭示饮食、社会性及地理因素对木蜂微生物组结构的影响
- 生物多样性研究: 利用微生物分类数据开展木蜂相关微生物资源的多样性评估