数据集概述
本数据集围绕亚南极海鸟细嘴锯鹱(Pachyptila belcheri)微卫星标记的跨物种适用性展开,包含通过下一代测序开发的标记在近缘物种中的扩增测试结果,以及相关的进化因素分析数据,共4个文件,涉及基因组测序、基因型数据、系统发育树及遗传距离矩阵等内容。
文件详解
- Tree files and pairwise distance matrices.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含物种间系统发育树文件及成对遗传距离矩阵,用于分析物种间的遗传分化关系
- Cytochrome B ALignment and Tree.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含细胞色素B基因序列比对文件及对应的系统发育树,用于比较微卫星标记与线粒体DNA的进化关系
- NGS shotgun data from Pachytila belcheri.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含细嘴锯鹱的下一代测序 shotgun 基因组数据,是开发微卫星标记的原始数据来源
- Prions_Msat_genotypes_by_Species_Final.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含不同海鸟物种的微卫星基因型数据,记录各物种在目标微卫星位点上的基因型信息
适用场景
- 海鸟遗传学研究: 分析微卫星标记在海鸟近缘物种中的跨物种扩增效率与多态性变化
- 进化生物学分析: 探究微卫星标记与线粒体DNA距离的非线性关系,研究同源性等位基因大小类群的进化影响
- 系统发育推断方法评估: 比较基于微卫星FST与DC值构建的物种树与线粒体DNA树的一致性,评估微卫星在远缘物种系统发育中的适用性
- 分子标记开发应用: 为亚南极海鸟及近缘物种的微卫星标记开发与跨物种应用提供数据参考