数据集概述
本数据集包含基于PANDA结果的分析复现数据，与论文“Dual decoding of cell types and gene expression in spatial transcriptomics with PANDA”的内容一致。数据分为模拟和应用两类场景，共9个压缩文件，用于支持空间转录组中细胞类型与基因表达双解码的分析复现。
文件详解
- 模拟场景文件（Simulations）
- 文件名称：paired_scenario.zip、unpaired_scenario.zip、merfish.zip、reference_choice.zip、parameter_sensitivity.zip、time_memory.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：对应模拟场景下的分析数据，包含配对/非配对场景、MERFISH数据、参考选择、参数敏感性、时间与内存分析相关的复现文件
- 应用场景文件（Applications）
- 文件名称：melanoma.zip、mouse_brain.zip、human_heart.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：对应应用场景下的分析数据，包含黑色素瘤、小鼠脑、人类心脏样本的空间转录组分析复现文件
数据来源
论文“Dual decoding of cell types and gene expression in spatial transcriptomics with PANDA”
适用场景
- 空间转录组分析方法复现: 用于重现PANDA方法在细胞类型与基因表达双解码任务中的分析结果
- 模拟场景验证: 支持配对/非配对场景、参数敏感性、时间内存消耗等模拟实验的验证与分析
- 生物样本应用研究: 基于黑色素瘤、小鼠脑、人类心脏等真实样本数据，开展空间转录组应用研究
- 参考选择策略评估: 通过reference_choice.zip数据，分析不同参考选择对PANDA方法性能的影响
