数据集概述
本数据集围绕加州刺龙虾(Panulirus interruptus)的种群遗传分化展开研究,结合亲缘关系估计与传统F统计量,分析高基因流背景下种群遗传分化的驱动因素。数据包含采样位点GPS信息、微卫星基因型数据及CO1基因序列比对结果,用于揭示该物种在长浮游幼体期下的遗传结构特征,为理解海洋生物扩散与遗传斑块性提供支持。
文件详解
- 文件名称:PintSampleSiteGPS.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含加州刺龙虾采样位点的GPS地理坐标信息,支持种群遗传结构的地理相关性分析。
- 文件名称:PintMsatGenotypes.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录七个核微卫星位点的基因型数据,用于计算FST等种群遗传分化指标及亲缘关系分析。
- 文件名称:PintCO1AlignmentGeneious.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含线粒体CO1基因的序列比对结果,用于分析mtDNA的种群遗传分化(ΦST等指标)。
数据来源
论文“Combined analyses of kinship and FST suggest potential drivers of chaotic genetic patchiness in high gene flow populations”
适用场景
- 海洋种群遗传学研究: 分析加州刺龙虾的种群遗传结构、分化程度及亲缘关系模式。
- 生物扩散机制探究: 结合遗传数据与地理信息,研究长浮游幼体期物种的扩散能力与局部 recruitment 特征。
- 遗传分化驱动因素分析: 探索亲缘关系、上升流强度等因素对种群遗传分化的影响。
- 海洋生物保护策略制定: 基于种群遗传结构结果,为加州刺龙虾的资源管理与保护提供科学依据。
- 分子生态学方法应用: 验证亲缘关系分析与F统计量结合在揭示隐性生活史特征中的有效性。